Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFCDQ8IXH7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NELFCDQ8IXH7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms