Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHSY1Q86X52 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHSY1Q86X52 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms