Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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