Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF5Q86SE9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF5Q86SE9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms