Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms