Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms