Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HS2ST1Q7LGA3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HS2ST1Q7LGA3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms