Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HECW1Q76N89 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms