Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARA5Q6ZMJ2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms