Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms