Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG3Q6UXM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms