Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1LQ6UX01 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1LQ6UX01 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms