Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms