Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SARM1Q6SZW1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARM1Q6SZW1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms