Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCD3Q6STE5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms