Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC4Q6S5L8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHC4Q6S5L8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHC4Q6S5L8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms