Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms