Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK3Q6PHR2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ULK3Q6PHR2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ULK3Q6PHR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ULK3Q6PHR2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ULK3Q6PHR2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms