Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK5Q6P3R8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms