Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED27Q6P2C8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED27Q6P2C8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms