Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms