Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRNP1Q6NT89 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms