Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms