Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTRHD1Q6GMV3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTRHD1Q6GMV3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms