Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms