Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms