Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM68Q6AZZ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms