Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUPD1Q68J44 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms