Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG9BQ674R7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms