Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WSCD1Q658N2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms