Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM104BQ5XKR9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms