Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms