Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUSD4Q5VX71 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms