Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DIPQ5VU43 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DIPQ5VU43 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms