Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR78Q5VTH9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms