Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP350Q5VT06 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP350Q5VT06 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP350Q5VT06 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms