Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms