Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPANXN1Q5VSR9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPANXN1Q5VSR9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms