Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERCC6L2Q5T890 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERCC6L2Q5T890 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms