Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC183Q5T5S1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms