Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3CQ5T2N8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3CQ5T2N8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3CQ5T2N8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3CQ5T2N8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3CQ5T2N8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATAD3CQ5T2N8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms