Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5PR19 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5PR19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5PR19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5PR19 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5PR19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5PR19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5PR19 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms