Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC27A3Q5K4L6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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