Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms