Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIN3Q5JUX0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIN3Q5JUX0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms