Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERC4Q5GLZ8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC4Q5GLZ8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms