Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms