Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms