Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms