Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9B1Q4ZJI4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9B1Q4ZJI4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms